Wbija się w dno rzeki specjalne pale stalowe, ten system ma jakąś nazwę, ale zapomniałem jak się nazywa, potem wypompowuje się wodę i masz dno w którym robisz wykop i instalujesz fundamenty i filary mostu.
Zobacz jak w Gdańsk / pod Gdańskiem buduje się mosty na Wiśle:
http://www.trojmiasto.pl/wiadomosci/Glebokie-wykopy-w-korycie-Wisly-Tak-powstaja-mosty-na-siodemce-n109545.html?expand=12526645&hl=12526645#op12526645